A genomic view of mRNA turnover in yeast
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A genomic view of mRNA turnover in yeast

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A genomic view of mRNA turnover in yeast

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dc.contributor.author Pérez Ortín, José Enrique
dc.contributor.author Jordán Plá, Antonio
dc.contributor.author Pelechano García, Vicente José
dc.date.accessioned 2013-12-04T11:37:47Z
dc.date.available 2013-12-04T11:37:47Z
dc.date.issued 2011
dc.identifier.uri http://dx.doi.org/10.1016/j.crvi.2011.05.013
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10550/31730
dc.description.abstract The steady-state mRNA level is the result of two opposing processes: transcription and degradation; both of which can provide important points to regulate gene expression. In the model organism yeast Saccharomyces cerevisiae, it is now possible to determine, at the genomic level, the transcription and degradation rates, as well as the mRNA amount, using DNA chip or parallel sequencing technologies. In this way, the contribution of both rates to individual and global gene expressions can be analysed. Here we review the techniques used for the genomic evaluation of the transcription and degradation rates developed for this yeast, and we discuss the integration of the data obtained to fully analyse the expression strategies used by yeast and other eukaryotic cells. Le taux de l"ARNm est maintenu à l"équilibre grâce à deux processus antagonistes : la transcription et la dégradation. Ces deux mécanismes sont cruciaux pour réguler l"expression des gènes. Dans l"organisme modèle Saccharomyces cerevisiae, il est maintenant possible de déterminer, au niveau génomique, les taux respectifs de transcription et de dégradation, ainsi que la quantité d"ARNm présente, en utilisant les puces à ADN ou le séquençage en parallèle. De cette manière, il est possible de connaître la contribution de chacun de ces processus en analysant le niveau d"expression des gènes individuellement et globalement. Nous présentons et comparons dans cet article les techniques utilisées pour évaluer les taux respectifs de transcription et de dégradation des transcrits de cette levure. Nous discutons la possibilité de l"utilisation des données obtenues pour analyser en profondeur les stratégies d"expression employées par la levure ainsi que par d"autres cellules eucaryotes. --------------------------------------------------------------------------------
dc.relation.ispartof Comptes Rendus Biologies, 2011, vol. 334, num. 8-9, p. 647-654
dc.rights.uri info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source Pérez Ortín, José Enrique Jordán Pla, Antonio Pelechano García, Vicente José 2011 A genomic view of mRNA turnover in yeast Comptes Rendus Biologies 334 8-9 647 654
dc.subject Genòmica
dc.subject Transcripció genètica
dc.subject RNA
dc.subject Saccharomyces cerevisiae
dc.title A genomic view of mRNA turnover in yeast
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.date.updated 2013-12-04T11:37:47Z
dc.identifier.doi http://dx.doi.org/10.1016/j.crvi.2011.05.013
dc.identifier.idgrec 068060

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