EvalMSA: a Program to Evaluate Multiple Sequence Alignments and Detect Outliers
NAGIOS: RODERIC FUNCIONANDO

EvalMSA: a Program to Evaluate Multiple Sequence Alignments and Detect Outliers

Repositori DSpace/Manakin

Degut a la parada de sistemes pevista a la Universitat de València del 19 al 22 de Gener, Roderic també romadrá fora de servei des del 19 a les 21:00 hores fins al 22 a les 17:00 hores. Disculpeu les molèsties. _______________________________________________________________________________________ Debido a la parada de sistemas prevista en la Universitat de València del 19 al 22 de Enero, Roderic también permanecerá fuera de servicio desde el 19 a las 21:00 hasta el 22 a las 17:00. Disculpen las molestias.

EvalMSA: a Program to Evaluate Multiple Sequence Alignments and Detect Outliers

Mostra el registre complet de l'element

Visualització       (773.9Kb)

Exportar a Refworks
    
Chiner-Oms, Alvaro; González Candelas, Fernando Perfil
Aquest document és un/a article, creat/da en: 2016
We present EvalMSA, a software tool for evaluating and detecting outliers in multiple sequence alignments (MSAs). This tool allows the identification of divergent sequences in MSAs by scoring the contribution of each row in the alignment to its quality using a sum-of-pair-based method and additional analyses. Our main goal is to provide users with objective data in order to take informed decisions about the relevance and/or pertinence of including/retaining a particular sequence in an MSA. EvalMSA is written in standard Perl and also uses some routines from the statistical language R. Therefore, it is necessary to install the R-base package in order to get full functionality. Binary packages are freely available from http://sourceforge.net/projects/evalmsa/ for Linux and Windows.

    Chiner-Oms, Alvaro González Candelas, Fernando 2016 EvalMSA: a Program to Evaluate Multiple Sequence Alignments and Detect Outliers Evolutionary Bioinformatics 12 277 284
http://dx.doi.org/10.4137/EBO.S40583
distribuït sota llicència Creative Commons de Reconeixement-NoComercial 3.0 No adaptada

Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)

Mostra el registre complet de l'element

Cerca a RODERIC

Cerca avançada

Visualitza

Estadístiques