Objective: To identify genetic susceptibility variants for hypertension associated microalbuminuria. Methods: The study design was a nested case-control genetic association study. Three hundred and three patients were selected from one prospective cohort recruited in the hypertension clinic of two different hospitals with the objective of identify clinical factors associated with microalbuminuria. All the patients were less than 50y, hypertensive grade I and naïve regarding to the treatment at the time of the recruitment. Cases were those who developed microalbuminuria (UAE>=30 mg/day) during the follow up and controls were those who remained with an UAE less than 30 mg/day. UAE was assessed in 24 hour urinary and in two or three samples. The Nsp array of the Affymetrix Gene-Chip Human Mapping 500K was used for genotyping, BRLMM algorithm for inferring the genotypes and PLINK software for performing the association analysis after quality control procedures. Results: The final sample size compromised of 201 controls and 102 cases with genotypes for 250000 SNPs. A few polymorphisms and haplotypes resulted in an association with the presence of an increment in UAE expressed as a qualitative or as a quantitative trait. The significantly associated loci were 8p22 for UAE as a qualitative trait and 8q12.1, 2p11.2, 9p22.2 and 18q23 for the quantitative trait. Some possible candidate genes within the significantly associated loci are: MSR1 for the qualitative trait and IMPAD1, REEP1, BNC2, and CNDP1 for the quantitative trait. There was another group of SNPs which did not reach the statistical significance but they seemed to stand out from the rest of SNPs. Within those regions there were also some possible candidate genes such as ELMO, LOX1, NRP1 or PEBP1 among others. Conclusions: GWAS strategy has enabled the identification of some genomic areas with potential influence on UAE in hypertensive patients. We were able to replicate some of the previously reported linked or associated loci with renal damage.Objetivo: Identificar variantes genéticas de susceptibilidad al desarrollo de microalbuminuria en la hipertensión arterial esencial Métodos: Se trata de un estudio de asociación genética tipo caso-control anidado. Trescientos tres pacientes fueron seleccionados en las unidades de hipertensión de dos hospitales dentro un estudio de cohortes encaminado al estudio de aquellos factores clínicos que influyen en el desarrollo de microalbuminuria. Los pacientes seleccionados eran menores de 50 años con niveles de presión arterial en rango normal-alto o hipertensión grado 1 al inicio del periodo de seguimiento. Los casos fueron aquellos pacientes que desarrollaron microalbuminuria (EUA >=30 mg/día) durante el seguimiento y los controles aquellos que permanecieron normoalbuminuricos (EUA menor de 30 mg/día). EUA se determinó en orina de 24 horas y en dos o tres muestras consecutivas. Como plataforma de genotipado se utilizó el array Nsp del Gene-Chip Human Mapping 500K de Affymetrix. El algoritmo BRLMM se utilizó para inferir los genotipos y el software PLINK para realizar el estudio de asociación una vez realizados todos los controles de calidad oportunos característicos de este tipo de estudios. Resultados: La muestra final incluyó 201 controles y 102 casos con genotipos para mas de 250000 SNPs. Unos pocos polimorfismos y haplotipos resultaron asociados con el incremento de los niveles de EUA expresados como variable cualitativa o cuantitativa. Los loci que presentaron asociación significativa fueron: 8p22 para la EUA expresada como variable cualitativa y 8q12.1, 2p11.2, 9p22.2 y 18q23 fpara la asociación con la variable cuantitativa. Algunos de los posibles genes candidatos en la zonas de asociación geneética fueron:: MSR1 para la variable qualitativa y IMPAD1, REEP1, BNC2, y CNDP1 para la EUA expresada de forma cuantitativa. Otro grupo de marcadores no alcanzó la significación estadística a nivel de genoma completo pero aparecieron claramente destacados del resto. Dentro de esas regiones algunos posibles genes candidatos fueron : ELMO, LOX1, NRP1 o PEBP1 entre otros. Conclusiones: La estrategia de estudio genómico completo ha permitido la identificación de regiones cromosómicas con influencia potencial sobre la EUA en hipertensos. Algunas de las regiones cromosómicas previamente asociadas en estudios de asociación o de ligamiento han podido ser replicadas.